Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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