Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RABEP1Q15276 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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