Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms