Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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