Protein–RNA interactions for Protein: Q14190

SIM2, Single-minded homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM2Q14190 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SIM2Q14190 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM2Q14190 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms