Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE7AQ13946 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms