Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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