Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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MKRN3Q13064 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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