Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms