Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms