Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms