Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPL2Q05D32 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms