Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms