Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms