Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms