Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VBP1P61758 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VBP1P61758 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms