Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms