Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP9P55211 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms