Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP7P55210 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP7P55210 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP7P55210 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms