Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHX2P50458 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHX2P50458 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX2P50458 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX2P50458 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms