Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF6P49848 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF6P49848 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF6P49848 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF6P49848 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF6P49848 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF6P49848 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF6P49848 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF6P49848 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF6P49848 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms