Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms