Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms