Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRATP43155 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRATP43155 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms