Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF5P43026 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GDF5P43026 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GDF5P43026 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GDF5P43026 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF5P43026 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms