Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms