Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBRP36941 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBRP36941 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBRP36941 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms