Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFNP31947 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFNP31947 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFNP31947 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFNP31947 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFNP31947 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFNP31947 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFNP31947 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFNP31947 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFNP31947 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFNP31947 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SFNP31947 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFNP31947 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFNP31947 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFNP31947 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms