Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DNMT1P26358 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms