Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APCP25054 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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APCP25054 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APCP25054 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APCP25054 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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