Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms