Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF3P18847 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF3P18847 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF3P18847 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms