Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF1P18846 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF1P18846 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF1P18846 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF1P18846 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF1P18846 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms