Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms