Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFLP07196 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFLP07196 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFLP07196 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms