Protein–RNA interactions for Protein: O75971

SNAPC5, snRNA-activating protein complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC5O75971 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC5O75971 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms