Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCA5O60264 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms