Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms