Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A2O14975 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC27A2O14975 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms