Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C2AO00443 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms