Protein–RNA interactions for Protein: A6NGE7

URAD, Putative 2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URADA6NGE7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
URADA6NGE7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
URADA6NGE7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms