Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF316A6NFI3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms