Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMTA1Q9Y6Y1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms