Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms