Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED23Q9ULK4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms