Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms