Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms