Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms