Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms