Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFIP11Q9UBB9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms